RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 VCX3BQ9H321 246 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DIABLOQ9NR28 239 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.5□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DBX1A6NMT0 343 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 I3L2K1 104 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 M0R2N4 97 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PMP2P02689 132 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CD5P06127 495 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 RFX2P48378 723 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 HSPA13P48723 471 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SPINK9Q5DT21 86 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MOB3AQ96BX8 217 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TXN2Q99757 166 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 HRH4Q9H3N8 390 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.49□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0A6YYH2 397 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 A6NJ64 397 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 KNCNA6PVL3 124 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 GPR31O00270 319 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MIFP14174 115 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 C4BPBP20851 252 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 S100GP29377 79 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 GABARAPL2P60520 117 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF688P0C7X2 276 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MED14OSP0DP75 135 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SPP1P10451 314 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 NPBWR1P48145 328 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SCAND1P57086 179 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R46P59540 309 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 PRCDQ00LT1 54 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 LILRB2Q8N423 598 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35G3Q8N808 338 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 FCGR1BQ92637 280 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 RNF126Q9BV68 326 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 VSIRQ9H7M9 311 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 CELA1Q9UNI1 258 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-211ENST00000449757 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GVY2 172 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PS18 150 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 P0DMU3 169 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 FAM231AP0DMU4 169 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 FAM231CP0DMU5 169 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF114Q8NC26 417 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 METTL26Q96S19 204 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SCGB2A1O75556 95 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 AMBPP02760 352 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NPPCP23582 126 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HRH1P35367 487 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SNCAP37840 140 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 P2RY1P47900 373 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TSPAN5P62079 268 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SPARTQ8N0X7 666 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 X6R8D5 127 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 PKD1P98161 4303 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GU03 582 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms