RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 DHHO43323 396 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYGSP22914 178 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR1DP28221 377 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR82Q6UXN9 313 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGMAR1Q99720 223 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC30A6NM36 301 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MZ25 164 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EP34 96 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNHIT1O43257 154 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GDF1P27539 372 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GCHFRP30047 84 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 VWC2Q2TAL6 325 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRY4Q9C004 299 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 PI4KAP42356 2102 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXH1O75593 365 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FABP6P51161 128 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GFERP55789 205 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB37Q96AX2 223 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GX78 115 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf118A6NHY6 69 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 MFAP2P55001 183 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CKS1BP61024 79 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF12P61328 243 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 DRAM1Q8N682 238 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1L3Q8NH93 324 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF488Q96MN9 340 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNGR3O43761 229 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CGAP01215 116 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SCGB1A1P11684 91 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMPP49913 170 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GPM6AP51674 278 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TIGITQ495A1 244 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf128Q5T292 105 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX8Q7RTT4 187 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM168AQ92567 244 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf52Q96A22 123 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 OSTCQ9NRP0 149 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMA1P25391 3075 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP54Q96N23 3096 aa6.92□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CDIPTO14735 213 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDX2P32119 198 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD52Q0P140 79 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HES3Q5TGS1 186 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB119Q8N690 84 aa6.92□□□□□ -1.3
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