RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 IL9P15248 144 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 NTF3P20783 257 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL1P22362 96 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SDC4P31431 198 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRA3P34903 492 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 TGFBR1P36897 503 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R41P59536 307 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 COPZ1P61923 177 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PKIAP61925 76 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 Q5W150 140 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZR03 302 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 AMN1Q8IY45 258 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MKXQ8IYA7 352 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35F6Q8N357 371 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MCFD2Q8NI22 146 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CMBLQ96DG6 245 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ULBP3Q9BZM4 244 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM60AQ9NP50 221 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ENY2Q9NPA8 101 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SIPA1L1O43166 1804 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SPTBN2O15020 2390 aa3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MYH2Q9UKX2 1941 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4C46A6NHA9 309 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5H14A6NHG9 310 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM159BA6NKW6 160 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 I3L521 148 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ERS5 55 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OPN1SWP03999 348 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10J4P0C629 311 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ESDP10768 282 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK2P24941 298 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10J1P30954 320 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CA7P43166 264 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00313P59037 77 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF616Q08AN1 781 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 BIKQ13323 160 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 LYG1Q8N1E2 194 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4A5Q8NH83 315 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF5Q99942 180 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RASL12Q9NYN1 266 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 COPZ2Q9P299 210 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OPTCQ9UBM4 332 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SSR3Q9UNL2 185 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPRFP10586 1907 aa3.03□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GUL6 1792 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF23A1L1A6 192 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6C6A6NF89 314 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR31O00270 319 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 S1PR2O95136 353 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 APOMO95445 188 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 FSTL3O95633 263 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 NRASP01111 189 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 HRASP01112 189 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 KRASP01116 189 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 PDYNP01213 254 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHG2P01859 326 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHMP01871 453 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 BPGMP07738 259 aa3.02□□□□□ -1.93
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00869P0C866 280 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 173.9 ms