RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.07□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC17A3O00476 420 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPX1P07203 203 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AREGP15514 252 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HNF1AP20823 631 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GABRA2P47869 451 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8N976 141 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF2Q99496 336 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MT-CO2P00403 227 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00205P59089 165 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MMD2Q8IY49 270 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM222BQ8WU58 562 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UHRF2Q96PU4 802 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 V9GYV3 84 aa14.06□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNURFLB1AK76 121 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MT-ND6P03923 174 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR10J4P0C629 311 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTRLP40313 264 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IER3P46695 156 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COX19Q49B96 90 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PSG11Q9UQ72 335 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 F2Z2F3 143 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C19orf84I3L1E1 186 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RHOBP62745 196 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HTD2P86397 168 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR4A16Q8NH70 328 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1orf159Q96HA4 380 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WDR73Q6P4I2 378 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GNB4Q9HAV0 340 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.04□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 REG1AP05451 166 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STUMQ69YW2 141 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF843Q8N446 348 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FLNCQ14315 2725 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DIRC3C9JPN6 131 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SSTR5P35346 364 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCL17Q92583 94 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF114Q9Y508 228 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USF3Q68DE3 2245 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRBAP50851 2863 aa14.03□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C15orf65H3BRN8 121 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PROP1O75360 226 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CX3CL1P78423 397 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR5I1Q13606 314 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EDDM3AQ14507 147 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.02□□□□□ -0.16
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPINT2O43291 252 aa14.02□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FCGR3BO75015 233 aa14.02□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RELBQ01201 579 aa14.02□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.02□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM178BH3BS89 294 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPR12P47775 334 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAB7AP51149 207 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BATFQ16520 125 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NRN1Q9NPD7 142 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OSTCQ9NRP0 149 aa14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MGST3O14880 152 aa14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF253O75346 499 aa14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR5G3P0C626 314 aa14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGFBP2P18065 325 aa14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRTDAPP60985 99 aa14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERVK-16P61578 105 aa14□□□□□ -0.17
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEPPQ6URK8 271 aa14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms