RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433972.1

RPUSD3-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, human

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 1,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD3-208	ENST00000433972	CD7	P09564	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	CBLN1	P23435	193 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	LGI3	Q8N145	548 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	CCDC32	Q9BV29	185 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972		A0A1B0GW64	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	REG1A	P05451	166 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	VAMP1	P23763	118 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	KLK9	Q2XQG4	91 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	LYST	Q99698	3801 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPUSD3-208	ENST00000433972	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SNCA	P37840	140 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM187	Q14656	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		A0A0B4J293	547 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		A0A0B4J2A0	478 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	NDUFB6	O95139	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	NDUFB8	O95169	186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CCR6	P51684	374 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	RETN	Q9HD89	108 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	LYRM1	O43325	122 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		P0C879	139 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SPCS3	P61009	180 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR1P1	Q8NH06	330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SFT2D2	O95562	160 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CLEC3B	P05452	202 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	PLET1	Q6UQ28	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CACNG5	Q9UF02	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	BTNL8	Q6UX41	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms