RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 TXN2Q99757 166 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 U3KQ87 197 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OVOL1O14753 267 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 PRAF2O60831 178 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 CLEC3BP05452 202 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 INSL3P51460 131 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RPEL1Q2QD12 228 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 C2orf83Q53S99 150 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 DTD1Q8TEA8 209 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 DCUN1D4Q92564 292 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC140Q96MF4 163 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 I3L2K1 104 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 K7EIM0 57 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 BMPR1BO00238 502 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 WIPF1O43516 503 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ADAP1O75689 374 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 TRBV12-3P01733 135 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 IGLL1P15814 213 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ARL3P36405 182 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SLURP1P55000 103 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 GPHB5Q86YW7 130 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 MISP3Q96FF7 219 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RBKSQ9H477 322 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 MT-CO2P00403 227 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ID3Q02535 119 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 C1QL4Q86Z23 238 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 PEMTQ9UBM1 199 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 VWFP04275 2813 aa9.93□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SYNGR2O43760 224 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 PTTG1O95997 202 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 NPBWR1P48145 328 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 MFAP4P55083 255 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ACSM6Q6P461 480 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.92□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 PPP5D1E7EU14 171 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 G3V4G9 280 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 LGALS9O00182 355 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 TGOLN2O43493 480 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 NXPH3O95157 252 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 IFNA10P01566 189 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV3-23P01764 117 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 NPY1RP25929 384 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 GPR183P32249 361 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SYNJ2BPP57105 145 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 Q56UQ5 140 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OR10C1Q96KK4 312 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 S4R3C0 116 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.91□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OR2T8A6NH00 312 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 MPTX1A8MV57 137 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 F8W735 103 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SCGB2A1O75556 95 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OR2C1O95371 312 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 CTSGP08311 255 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 SLC25A4P12235 298 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 OPRK1P41145 380 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 RAB11AP62491 216 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 REC114Q7Z4M0 266 aa9.9□□□□□ -0.82
HDLBP-210ENST00000423693 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms