RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL4A6Q14031 1691 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R1B8 84 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 SC5DO75845 299 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERC2-IT1O76042 136 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRM2P04554 102 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD9P21926 228 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRM2P31350 389 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSN1S1P47710 185 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAFAH1B2P68402 229 aa-2.84□□□□□ -2.86
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RNU6-172P-201ENST00000411000 HBG2P69892 147 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf53Q8N6V4 93 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB105AQ8NG35 78 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52K2Q8NGK3 314 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4A4PQ8NGN8 299 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5K1Q8NHB7 308 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM111AQ96PZ2 611 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF122Q9H9V4 155 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-2.84□□□□□ -2.86
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 SBF1O95248 1867 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf92A6NGG3 77 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf87E5RJ46 101 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR171O14626 319 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 KHDC3LQ587J8 217 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51Q1Q8NH59 317 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC14L6B5MCN3 397 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 MPDU1O75352 247 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GSTM3P21266 225 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPN2P22792 545 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCND2P30279 289 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 AKR1D1P51857 326 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 HIKESHIQ53FT3 197 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPWQ5EE01 88 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4orf22Q6V702 233 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZRX8 168 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSX8Q7RTT4 187 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACY3Q96HD9 319 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBP7Q96R05 134 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GINS4Q9BRT9 223 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51E2Q9H255 320 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL15Q9H469 300 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
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