RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 J3KRW8 73 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GUCD1Q96NT3 240 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FABP2P12104 132 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DNLZQ5SXM8 178 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC15Q8N387 334 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PI4KAP42356 2102 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 HIGD1CA8MV81 97 aa13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IL4P05112 153 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PRCDQ00LT1 54 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6ZRM9 215 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR7Q8TB68 274 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GUT8 65 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TFF1P04155 84 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CD69Q07108 199 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FMC1Q96HJ9 113 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 MGPP08493 103 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6P435 159 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 WIPF3A6NGB9 483 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM27E3Q08E93 113 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IL18BPO95998 194 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PCP4P48539 62 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RABAC1Q9UI14 185 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CCL21O00585 134 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SRRM5B3KS81 715 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM106CPP0CH98 169 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 CYB5R2Q6BCY4 276 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C9JCJ5 164 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF841Q6ZN19 808 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 THADAQ6YHU6 1953 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ANOS1P23352 680 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB9AP51151 201 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IL15RAQ13261 267 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 AKAP6Q13023 2319 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 GCSHP23434 173 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 COLCA1Q6ZS62 124 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LIME1Q9H400 295 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ARF6P62330 175 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL26Q96S19 204 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TNFSF13O75888 250 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 Q0VFX4 171 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6AWC8 147 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PNKDQ8N490 385 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 B9A039 149 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 LILRA1O75019 489 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C2orf83Q53S99 150 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 C20orf204Q6ZNR8 217 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DERL1Q9BUN8 251 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GW15 77 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDT3O95989 172 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 BMPERQ8N8U9 685 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXL15Q9H469 300 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DOCK7Q96N67 2140 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM50AO95807 157 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMB2P49721 201 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 PLP1P60201 277 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 Q9H3A6 140 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2-201ENST00000398073 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C17orf100A8MU93 164 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CCL3L1P16619 93 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF585BQ52M93 769 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX45Q8NA69 505 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB37Q96AX2 223 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C16orf92Q96LL3 132 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 EPDR1Q9UM22 224 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF124Q15973 351 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MGST2Q99735 147 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms