RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 IQCF2Q8IXL9 164 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5B17Q8NGF7 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SFT2D1Q8WV19 159 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BHQ93079 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 BORCS5Q969J3 196 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 DIRAS2Q96HU8 199 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BNQ99877 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H2BMQ99879 126 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 C3orf18Q9UK00 162 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HS3ST2Q9Y278 367 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SBF1O95248 1867 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PIK3R4Q99570 1358 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0J9YY10 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GX78 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PFDN6O15212 129 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 REG1AP05451 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 EFNA4P52798 201 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB5BP61020 215 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 RHEBQ15382 184 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GRK1Q15835 563 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GUK1Q16774 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1orf137Q5JT78 98 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 LPCAT4Q643R3 524 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 MIR17HGQ75NE6 70 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GRINAQ7Z429 371 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR4E2Q8NGC2 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2T4Q8NH00 348 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR10J5Q8NHC4 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PATE1Q8WXA2 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 ULBP3Q9BZM4 244 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA8KD6RF30 607 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACOX3O15254 700 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 LYZL6O75951 148 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PROSCO94903 275 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 APOEP02649 317 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TYMSP04818 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPI1P17947 270 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SSR2P43308 183 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSG9Q00887 426 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 RSU1Q15404 277 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLVS2Q5SYC1 327 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRN1Q6UXK5 716 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q6ZS49 121 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 COMMD7Q86VX2 200 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GKN2Q86XP6 184 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 PIGXQ8TBF5 258 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CITO14578 2027 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0D9SG42 100 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAAHO00519 579 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SULT1B1O43704 296 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFNA10P01566 189 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1-5P01602 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5G3P0C626 314 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CRYGAP11844 174 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASQ1P31415 396 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP2K4P45985 399 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAA20P61599 178 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 KHDC3LQ587J8 217 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 COQ5Q5HYK3 327 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1orf195Q5TG92 126 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC00575Q6W349 94 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 C3orf56Q8N813 242 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GINS4Q9BRT9 223 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM25EA8MYX2 175 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 CXCR6O00574 342 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC16A4O15374 487 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 HOXA6P31267 233 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms