RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PRCDQ00LT1 54 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 HINT2Q9BX68 163 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 LY6HO94772 140 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 DLX1P56177 255 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 RBPJQ06330 500 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 JKAMPQ9P055 326 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 E7EQL1 145 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFB7P17568 137 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX38Q6PEX7 206 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IQCJQ1A5X6 159 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP37Q8NFH4 326 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf52Q96A22 123 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS2R60P59551 318 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SSX2Q16385 188 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL8BQ17RB0 113 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MT-CO2P00403 227 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF2P14316 349 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MISP3Q96FF7 219 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SAP30LQ9HAJ7 183 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 hADV38S2A0JD32 116 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf100A8MU93 164 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FCN3O75636 299 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SHISA9B4DS77 424 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SIAH2O43255 324 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF224P0DH78 156 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 WNK2Q9Y3S1 2297 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NUPR1O60356 82 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 AREGP15514 252 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 BET1LQ9NYM9 111 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 K7EN84 100 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB4BP61018 213 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MOB3BQ86TA1 216 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM122AQ96E09 287 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C9JCJ5 164 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 HNF1AP20823 631 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf83Q53S99 150 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP11Q9NYL4 201 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 LY96Q9Y6Y9 160 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GUS0 222 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CCL3L1P16619 93 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ADMP35318 185 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SELENOTP62341 195 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 UHRF2Q96PU4 802 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NABP2Q9BQ15 211 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTL6BO94805 426 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 KLRB1Q12918 225 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5B3Q8NH48 314 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 IL36BQ9NZH7 164 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 PLXNB1O43157 2135 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFHX3Q15911 3703 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF1AP19438 455 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CA7P43166 264 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35E1Q96K37 410 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF90Q03938 601 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM167BQ9NRX6 74 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP6P55212 293 aa15.21■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PSG5Q15238 335 aa15.21■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MLANAQ16655 118 aa15.21■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF503Q96F45 646 aa15.21■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA1O95477 2261 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms