RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR8B2Q96RD0 313 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 NAA60Q9H7X0 242 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 COMMD9Q9P000 198 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 THBS3P49746 956 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PAX9P55771 341 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF415Q09FC8 603 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 AWAT1Q58HT5 328 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 STPG4Q8N801 248 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 RNF183Q96D59 192 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 RAB40CQ96S21 281 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 MPPED1O15442 326 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 YPEL1O60688 119 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGLV2-14P01704 120 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGHV4-39P01824 125 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 WNT2P09544 360 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR10J1P30954 320 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MORN2Q502X0 79 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RAB39BQ96DA2 213 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF714Q96N38 554 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 YPEL2Q96QA6 119 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RSG1Q9BU20 258 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PRR13Q9NZ81 148 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 A0A0B4J2A0 478 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GNG12Q9UBI6 72 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE10A6NGK3 116 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR5AC1P0C628 307 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM187Q14656 261 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF525Q8N782 197 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR2D2Q9H210 308 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TAAR5O14804 337 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TRGC2P03986 189 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CCL3L1P16619 93 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ADCYAP1P18509 176 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 COL8A1P27658 744 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DLX6P56179 175 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 H2BFSP57053 126 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TIRAPP58753 221 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 DRAM1Q8N682 238 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GPHA2Q96T91 129 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MMP23AO75900 390 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MSMO1Q15800 293 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SP6Q3SY56 376 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 UTF1Q5T230 341 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RETNQ9HD89 108 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BKO60814 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR2A4O95047 310 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN13O95857 204 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3-7P01780 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BJP06899 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 OR13C7P0DN81 318 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BOP23527 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BBP33778 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 SULT1A1P50225 295 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 ZNF134P52741 427 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BDP58876 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2BCP62807 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.94□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms