RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF114Q8NC26 417 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SLC45A2Q9UMX9 530 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 FCN1O00602 326 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 LINC00869P0C866 280 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 8.5
UBXN6-201ENST00000301281 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 PVRIGQ6DKI7 326 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 C19orf35Q6ZS72 473 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 OR2T6Q8NHC8 308 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 GATAD1Q8WUU5 269 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 C20orf24Q9BUV8 137 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 FOXH1O75593 365 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MOSP00540 346 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 APELAP0DMC3 54 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MFAP2P55001 183 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 C10orf105Q8TEF2 133 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 FAM168AQ92567 244 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SLC35E1Q96K37 410 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 FBN2P35556 2912 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 A0A1W2PPV4 95 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 M0R036 132 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 NBR2O15453 112 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 OR10J1P30954 320 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 AKR1C3P42330 323 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 CD81P60033 236 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 PLGLAQ15195 96 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 IQCF2Q8IXL9 164 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 NPBQ8NG41 125 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MANBALQ9NQG1 85 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 OOSP1A8MZH6 123 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 NDUFA3O95167 84 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 STAG3L2P0CL84 134 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 STAG3L3P0CL85 134 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SMUG1Q53HV7 270 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 ACY3Q96HD9 319 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 LPAR2Q9HBW0 351 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 CENPEQ02224 2701 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 VWC2LB2RUY7 222 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 H3BQ15 152 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 ATP5J2P56134 94 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.97■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 PSMB3P49720 205 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 UBE2E1P51965 193 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 LGALS4P56470 323 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 AJUBAQ96IF1 538 aa15.96■□□□□ 0.15
UBXN6-201ENST00000301281 NDUFS8O00217 210 aa15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 IGHV3-48P01763 117 aa15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 HES1Q14469 280 aa15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 Q8N6K4 173 aa15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 RHOBP62745 196 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 RHEBQ15382 184 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 OR1P1Q8NH06 330 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 NRGNQ92686 78 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 CLEC2AQ6UVW9 174 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 PAGE4O60829 102 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 CRYGCP07315 174 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 NPIPB3Q92617 1050 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 MISP3Q96FF7 219 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 EBI3Q14213 229 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 THAP8Q8NA92 274 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN6-201ENST00000301281 PERPQ96FX8 193 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms