RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL26Q96S19 204 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIRQ9H7M9 311 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DAPK2Q9UIK4 370 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PRNDQ9UKY0 176 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 RFNGQ9Y644 331 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CGB1A6NKQ9 187 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EIM0 57 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 EREGO14944 169 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PAX4O43316 350 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF688P0C7X2 276 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 C4BPBP20851 252 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MISP3Q96FF7 219 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf4Q9NR00 106 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PKD1P98161 4303 aa5.62□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EQG2 157 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF12O43508 249 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN12P56749 244 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG2P59768 71 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DAD1P61803 113 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 WT1-ASQ06250 92 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 INSL4Q14641 139 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SPHARQ15513 63 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 AHSA2Q719I0 299 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CYGBQ8WWM9 190 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 C18orf15Q96N68 181 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.61□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH11A6NNE9 402 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 KNCNA6PVL3 124 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CORTO00230 105 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SULT1C2O00338 296 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-CO2P00403 227 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV2-14P01704 120 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HBE1P02100 147 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 S100GP29377 79 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH3B2P48448 385 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRS2Q13268 280 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CLINT1Q14677 625 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMG4Q5JS54 123 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HES5Q5TA89 166 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 HACD4Q5VWC8 232 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM230Q96A57 120 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB40CQ96S21 281 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 XCL2Q9UBD3 114 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DKK2Q9UBU2 259 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.6□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL9P24844 172 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGR2CP31995 323 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SNCAP37840 140 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY1P47900 373 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CDNFQ49AH0 187 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51H1Q8NH63 302 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM203Q969S6 136 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN3BQ9NY72 215 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms