RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SRIP30626 198 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PDLIM4P50479 330 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FAM201AQ5SY85 155 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PGPA6NDG6 321 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A17O43808 307 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 CAMPP49913 170 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FAM27E3Q08E93 113 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FXYD3Q14802 87 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 Q6ZN92 141 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.27□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 Q0VG73 95 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 CR1LQ2VPA4 569 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FAM222BQ8WU58 562 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 DERL1Q9BUN8 251 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 LOXL3P58215 753 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 SERF1AO75920 110 aa7.26□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OR5I1Q13606 314 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TCF23Q7RTU1 214 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 COX7A1P24310 79 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 Q6ZS92 163 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 GUSBP1Q15486 140 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C5orf30Q96GV9 206 aa7.25□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 A8MWP6 167 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FOXH1O75593 365 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 LHBP01229 141 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FCER1GP30273 86 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 Q56UQ5 140 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PIP4P1Q86T03 277 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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HERC3-201ENST00000264345 BSPH1Q075Z2 132 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PTTG1IPP53801 180 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 LINC00205P59089 165 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 LINC00311Q8N616 119 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TRGV9Q99603 122 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 RNF5Q99942 180 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OTORQ9NRC9 128 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRR20EP86478 221 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRR20CP86479 221 aa7.24□□□□□ -1.25
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