RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ESDP10768 282 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRA2P47869 451 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS8O00217 210 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-CO2P00403 227 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF1AP19438 455 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5G3P48201 142 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A10Q96PG2 267 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM106BQ9NUM4 274 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5T1Q8NG75 326 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10G8Q8NGN5 311 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00473A8K010 186 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A16P16260 332 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM21Q3B7S5 101 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGPRDQ8TDS7 321 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DS2P43631 304 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf53Q8IXP5 236 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4A16Q8NH70 328 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 USF1P22415 310 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 EDDM3BP56851 147 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TPPP2P59282 170 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL19P84098 196 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 MZT1Q08AG7 82 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 TREML4Q6UXN2 200 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 Q71RC1 249 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-201ENST00000246533 DUTP33316 252 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2G2P60604 165 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-16P61578 105 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 RANP62826 216 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM2Q8TAZ6 248 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 C9JCJ5 164 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 GATA4P43694 442 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR12P47775 334 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP1-1Q07627 177 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX38Q6PEX7 206 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 IL36BQ9NZH7 164 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG11Q9UQ72 335 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM178BH3BS89 294 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9G9P0C7N8 305 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL14EPLP0DKL9 152 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf52Q96A22 123 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 GGTLC1Q9BX51 225 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 JPT1Q9UK76 154 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.011e-6■■■□□ 15.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS46E5RG02 174 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB4AP20338 218 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 NPVFQ9HCQ7 196 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf65H3BRN8 121 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR82Q6UXN9 313 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 UHRF2Q96PU4 802 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 DERL1Q9BUN8 251 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SNHG12Q9BXW3 62 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 EREGO14944 169 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 AREGP15514 252 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOBP62745 196 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB31Q13636 194 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13A1Q8NGR1 328 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 MGST2Q99735 147 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf144Q9BQM9 153 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC10F2Z333 226 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 LY6G6DO95868 133 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ADMP35318 185 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS16P62249 146 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS8Q16651 343 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 COX19Q49B96 90 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM256Q8N2U0 113 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 YPEL1O60688 119 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SSTR5P35346 364 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINK9Q5DT21 86 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 GCSAMLQ5JQS6 135 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF114Q8NC26 417 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO2AQ92828 525 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 YPEL2Q96QA6 119 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF90Q03938 601 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 CR1LQ2VPA4 569 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A1Q86YD7 464 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 OCC1Q8TAD7 63 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8TCH9 128 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-201ENST00000246533 WNK2Q9Y3S1 2297 aa21.33■■□□□ 1.01
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