RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 IGSF23A1L1A6 192 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 C15orf61A6NNL5 157 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OOSP1A8MZH6 123 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 TAAR5O14804 337 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 NXPH3O95157 252 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 FAM106CPP0CH98 169 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SSX9Q7RTT3 188 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR8H3Q8N146 312 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 STOML3Q8TAV4 291 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 RNF5Q99942 180 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.37□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SORL1Q92673 2214 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 WRBO00258 174 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SHOXO15266 292 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 TSC22D2O75157 780 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 MED6O75586 246 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 CD1BP29016 333 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 CEACAM3P40198 252 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 LGALS7P47929 136 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR2B8PP59922 312 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SPCS3P61009 180 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 NHLH2Q02577 135 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 FHL3Q13643 280 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 EBI3Q14213 229 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 STPG2Q8N412 459 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR11H1Q8NG94 326 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR4A5Q8NH83 315 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 RPEQ96AT9 228 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 HARBI1Q96MB7 349 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 ARV1Q9H2C2 271 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 FBXL17Q9UF56 701 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.36□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 H7C2Y5 167 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SAP30O75446 220 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 KBTBD11O94819 623 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 VAMP2P63027 116 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 BAXQ07812 192 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 TEX45Q8NA69 505 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR4A16Q8NH70 328 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 DTD1Q8TEA8 209 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 ST8SIA2Q92186 375 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 WFDC1Q9HC57 220 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 PSENENQ9NZ42 101 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 PRNDQ9UKY0 176 aa8.35□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 CGB1A6NKQ9 187 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 IGHG2P01859 326 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 IAPPP10997 89 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 SULT1A1P50225 295 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 CAV2P51636 162 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 ARL16Q0P5N6 197 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 FOXE3Q13461 319 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 MOB3BQ86TA1 216 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 Q8N6K4 173 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 OR4C12Q96R67 309 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.34□□□□□ -1.07
APOC3-201ENST00000227667 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 LINC01548A6NM66 108 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 H3BP45 60 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 AP4M1O00189 453 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 NDUFA3O95167 84 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 SPDEFO95238 335 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 IFNA7P01567 189 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 ELANEP08246 267 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 OR8U8P0C7N1 319 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 MYOD1P15172 320 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 CNTFRP26992 372 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 PRCDQ00LT1 54 aa8.33□□□□□ -1.08
APOC3-201ENST00000227667 HES1Q14469 280 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms