RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641281.1

CCDC196-208, Transcript of coiled-coil domain containing 196, human

Gene CCDC196, Length 1,018 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MAS1L	P35410	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	PRDX6	P30041	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GNRHR	P30968	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2B8P	P59922	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DAD1	P61803	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CLINT1	Q14677	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		E9PI62	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		J3QRE1	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CYB5B	O43169	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ASIP	P42127	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DAP	P51397	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	FCGR3B	O75015	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	KBTBD11	O94819	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		P0C879	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CRHBP	P24387	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SERPINB10	P48595	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	LINC00315	P59091	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		Q56UQ5	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC196-208	ENST00000641281	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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