RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 FCER2P06734 321 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NSG2Q9Y328 171 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51B2Q9Y5P1 312 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NOTOA8MTQ0 251 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSGP08311 255 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MED14OSP0DP75 135 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LEMD1Q68G75 181 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF24Q7RTU0 167 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DAPK2Q9UIK4 370 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH11A6NNE9 402 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP4P55087 323 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB131AP59861 70 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS14Q8TCE9 139 aa19.94■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAPC5O75971 98 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DMBP28068 263 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A46Q96AG3 418 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MISP3Q96FF7 219 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HRH4Q9H3N8 390 aa19.93■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV10A0A0B4J240 114 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf61A6NNL5 157 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HOGA1Q86XE5 327 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 STHQ8IWL8 128 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8NAQ8 132 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 GIMAP1Q8WWP7 306 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM56Q96MV1 263 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDL2Q9NX52 303 aa19.92■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV18A0A075B6X5 111 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MFAP4P55083 255 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HERV-K104P61576 105 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL11P62913 178 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A2PQ658T7 463 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZTC4 211 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN14Q8NG11 270 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10C1Q96KK4 312 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVY2 172 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ST8SIA3O43173 380 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 KRASP01116 189 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 RLN1P04808 185 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 GINS3Q9BRX5 216 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA13Q86UQ4 5058 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS29PA6NIE9 313 aa19.89■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 G6PCP35575 357 aa19.89■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 BORCS5Q969J3 196 aa19.89■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF414Q96IQ9 312 aa19.89■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A6AQ9H2W1 248 aa19.89■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FAT2Q9NYQ8 4349 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DFFBO76075 338 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-48P01763 117 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 CD5P06127 495 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMY1CP0DJD4 496 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 LPAR6P43657 344 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1P1Q8NH06 330 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 ST8SIA2Q92186 375 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RABAC1Q9UI14 185 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PRNDQ9UKY0 176 aa19.88■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 GNG7O60262 68 aa19.87■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 F2RP25116 425 aa19.87■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TPRA1Q86W33 373 aa19.87■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH2Q9P225 4427 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MIFP14174 115 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PVRIGQ6DKI7 326 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 SFXN4Q6P4A7 337 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM24BQ8N5W8 94 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FCAMRQ8WWV6 532 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TXN2Q99757 166 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP11Q9NYL4 201 aa19.86■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PKHD1P08F94 4074 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R2N4 97 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-CO2P00403 227 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 GNRHRP30968 328 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AP2Q8NGF4 316 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF126Q9BV68 326 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 BLOC1S6Q9UL45 172 aa19.85■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIS3P1A6NDR6 274 aa19.84■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 I3L2K1 104 aa19.84■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 EHFQ9NZC4 300 aa19.84■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 APOHP02749 345 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM41BQ5BJD5 291 aa19.83■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TOMM20LQ6UXN7 152 aa19.83■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP18Q8NEJ0 188 aa19.83■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TSC22D3Q99576 134 aa19.83■□□□□ 0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH17Q9UFH2 4485 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms