RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	UHRF2	Q96PU4	802 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK15	Q9H427	330 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	EHF	Q9NZC4	300 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	RFNG	Q9Y644	331 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2T8	A6NH00	312 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRPB1	O00241	398 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TGFA	P01135	160 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNA1	P01562	189 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TTR	P02766	147 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	DLX1	P56177	255 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM46B	Q96A09	425 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4F4	Q96R69	305 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		5.99	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	MLNR	O43193	412 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	CD5L	O43866	347 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF253	O75346	499 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	PITX3	O75364	302 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	CD33	P20138	364 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	AADAC	P22760	399 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	THBS3	P49746	956 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	PSG9	Q00887	426 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF144B	Q7Z419	303 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	KBTBD11	O94819	623 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ECI1	P42126	302 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTDAP	P60985	99 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	GNG13	Q9P2W3	67 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	CKLF	Q9UBR5	152 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	DHDH	Q9UQ10	334 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495		R4GMQ9	66 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	CUBN	O60494	3623 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EQM0	130 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R1X1	148 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	NRAS	P01111	189 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FST	P19883	344 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	IL3RA	P26951	378 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	EFNA4	P52798	201 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495		Q0VG73	95 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FGFRL1	Q8N441	504 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM206A	Q9NX38	181 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR13	Q9NZ81	148 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		5.98	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	NF1	P21359	2839 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	MPPED1	O15442	326 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SERF1A	O75920	110 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	GYPA	P02724	150 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	NPBWR2	P48146	333 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	EDDM3A	Q14507	147 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	UBALD1	Q8TB05	177 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC29	Q8WV35	223 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		5.97	□□□□□ -1.45
LETMD1-238	ENST00000623495	XRCC2	O43543	280 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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