RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GCM1Q9NP62 436 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CXCL13O43927 109 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CRYBB3P26998 211 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CRYBA4P53673 196 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CENPWQ5EE01 88 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 NINJ1Q92982 152 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GUCD1Q96NT3 240 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 COL4A2P08572 1712 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 VPS13CQ709C8 3753 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 NEURL1O76050 574 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SSR4P51571 173 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GPM6AP51674 278 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF138P52744 262 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 NABP1Q96AH0 204 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM45BQ96B21 275 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00869P0C866 280 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CA6P23280 308 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RHOBP62745 196 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 HES3Q5TGS1 186 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CD5LO43866 347 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CGAP01215 116 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MFAP2P55001 183 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CX3CL1P78423 397 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 OR8B8Q15620 311 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 DHRS13Q6UX07 377 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZFHX3Q15911 3703 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 AMY1AP04745 511 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LIFP15018 202 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GNG4P50150 75 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TBR1Q16650 682 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FAM27BQ5VT28 67 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FADS6Q8N9I5 356 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 STRADBQ9C0K7 418 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 HES4Q9HCC6 221 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GV72 72 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 K7ESF4 209 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SYNGR1O43759 233 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 AGFG2O95081 481 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MT-CO3P00414 261 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV2-14P01704 120 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 GPR183P32249 361 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf128Q5T292 105 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 WDR82Q6UXN9 313 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 MTURNQ8N3F0 131 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM54Q969K7 222 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FOXB1Q99853 325 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 DYSFO75923 2080 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 RHBDL1O75783 438 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 P04436 131 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 HTR1DP28221 377 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CKS1BP61024 79 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PCOLCEQ15113 449 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 TEX45Q8NA69 505 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00479Q96M42 142 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V0BQ99437 205 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-211ENST00000618610 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.79□□□□□ -1.32
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