RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 MCUBQ9NWR8 336 aa9.05□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 CENPXA8MT69 81 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 LYRM1O43325 122 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 HLA-GP17693 338 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 MAS1LP35410 378 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 OR2B8PP59922 312 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 TM4SF20Q53R12 229 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 OR4A47Q6IF82 309 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 TERB2Q8NHR7 220 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 PRRT1Q99946 306 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 HRASP01112 189 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 CLEC3BP05452 202 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 GPR183P32249 361 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 BTCP35070 178 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 DEFA1P59665 94 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 DEFA3P59666 94 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 HERV-K104P61576 105 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 MOB3AQ96BX8 217 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 BET1LQ9NYM9 111 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.02□□□□□ -0.96
CTIF-208ENST00000590422 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 DHFRP00374 187 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 DEFA4P12838 97 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 UCP3P55916 312 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 FXYD4P59646 89 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 POU2AF1Q16633 256 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.02□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 C8orf88P0DMB2 117 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 CCR6P51684 374 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 ZNF585BQ52M93 769 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 OR51H1Q8NH63 302 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 OR4A5Q8NH83 315 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 CXorf58Q96LI9 332 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.01□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 A0A0J9YWU9 116 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 UPK2O00526 184 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 S1PR2O95136 353 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 NDUFB6O95139 128 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 RPA2P15927 270 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 GNRHRP30968 328 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R31P59538 309 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 PMS2P11Q13670 270 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 OR1L6Q8NGR2 347 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 TMEM190Q8WZ59 177 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 TMEM140Q9NV12 185 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 GPR132Q9UNW8 380 aa9□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 KMT2AQ03164 3969 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 CXorf65A6NEN9 183 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 OR2T8A6NH00 312 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 FGF2P09038 288 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 PGAM2P15259 253 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 MFAP2P55001 183 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 WT1-ASQ06250 92 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 DEFB135Q30KP9 77 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 PLET1Q6UQ28 207 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.99□□□□□ -0.97
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CTIF-208ENST00000590422 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 MARC2Q969Z3 335 aa8.99□□□□□ -0.97
CTIF-208ENST00000590422 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.99□□□□□ -0.97
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