RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346		F5H697	171 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346		M0QZK8	103 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ZG16	O60844	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	RAMP3	O60896	148 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	WISP2	O76076	250 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	AMBP	P02760	352 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SOD3	P08294	240 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	STAG3L2	P0CL84	134 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	AREG	P15514	252 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TNFSF10	P50591	281 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TPPP2	P59282	170 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TAS2R60	P59551	318 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SELENOV	P59797	346 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	COL10A1	Q03692	680 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PSG7	Q13046	419 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	WDR82	Q6UXN9	313 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SSX7	Q7RTT5	188 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	OR1L1	Q8NH94	360 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SDSL	Q96GA7	329 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	COQ2	Q96H96	371 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SFRP2	Q96HF1	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	NEU1	Q99519	415 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CLN8	Q9UBY8	286 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PSG11	Q9UQ72	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	MED12L	Q86YW9	2145 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	LNP1	A1A4G5	178 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ARGFX	A6NJG6	315 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	C15orf65	H3BRN8	121 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346		M0R1X1	148 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SLC31A2	O15432	143 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PAGE4	O60829	102 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FCGR3B	O75015	233 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	IGKV1D-33	P01593	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	IGKV1-33	P01594	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	OR10J4	P0C629	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CECR9	P0C854	216 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ESD	P10768	282 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	RAB4A	P20338	218 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TNFSF4	P23510	183 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	NPY1R	P25929	384 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	GCHFR	P30047	84 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	PRDX2	P32119	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	MPV17	P39210	176 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	SELENOT	P62341	195 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TFF3	Q07654	80 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	AES	Q08117	197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	GAMT	Q14353	236 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	HES3	Q5TGS1	186 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	CST9LP1	Q5W188	147 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	RASL11A	Q6T310	242 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NSF-208	ENST00000576346	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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