RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 FOXH1O75593 365 aa18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 COL8A2P25067 703 aa18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 C4orf17Q53FE4 359 aa18.81■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa18.8■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 B9A039 149 aa18.8■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 GAMTQ14353 236 aa18.8■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.8■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa18.8■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 A0A087X0M5 115 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 A0A1B0GX30 115 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 SCO2A0A1W2PP80 73 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 PLAUP00749 431 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR4P4Q8NGL7 312 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR4A5Q8NH83 315 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 NIT2Q9NQR4 276 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 CHRNA7P36544 502 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 SRP14P37108 136 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 ZNF137PP52743 207 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 MIR17HGQ75NE6 70 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 ZNF114Q8NC26 417 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR4X1Q8NH49 305 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR9G1Q8NH87 305 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 PCGF1Q9BSM1 259 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 ACTL6BO94805 426 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 MT-CO2P00403 227 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 SOD3P08294 240 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 CD69Q07108 199 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 MLANAQ16655 118 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 FAM78BQ5VT40 261 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 GFI1BQ5VTD9 330 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 SLC35E1Q96K37 410 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PPQ1 181 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 PGPEP1LA6NFU8 196 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 E7EUB6 86 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 INS-IGF2F8WCM5 200 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R2P9O14990 202 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 GGCTO75223 188 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 IGLV2-23P01705 113 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 IGHV1-8P0DP01 117 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 CD99P14209 185 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR10J1P30954 320 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 HIST3H2BBQ8N257 126 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 LINC01560Q8TB33 94 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 FUT9Q9Y231 359 aa18.78■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 DLL1O00548 723 aa18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 ERHP84090 104 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 OR2T10Q8NGZ9 312 aa18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 VSTM2AQ8TAG5 236 aa18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 POLEQ07864 2286 aa18.77■□□□□ 0.6
EHD4-202ENST00000569223 PPP5D1E7EU14 171 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 C1QTNF9P0C862 333 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 S100A2P29034 98 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 A0A1W2PN81 502 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 CGB1A6NKQ9 187 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 CASP6P55212 293 aa18.75■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 GPR61Q9BZJ8 451 aa18.75■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 TMEM133Q9H2Q1 129 aa18.75■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 CA7P43166 264 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 C10orf55Q5SWW7 151 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 KCNIP4Q6PIL6 250 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 C11orf52Q96A22 123 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 WT1-ASQ06250 92 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 PDZD11Q5EBL8 140 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 CACNG8Q8WXS5 425 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 LYNX1G3V0Z9 82 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 TYMSP04818 313 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 OR5G3P0C626 314 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 LYNX1P0DP58 116 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 PNKDQ8N490 385 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 SFRP2Q96HF1 295 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 UHRF2Q96PU4 802 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 AREGP15514 252 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 IL3RAP26951 378 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-202ENST00000569223 GRNP28799 593 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms