RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147		A8MWP6	167 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	TBP	P20226	339 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	HAGH	Q16775	308 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	TGOLN2	O43493	480 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	CD7	P09564	240 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	PIGP	P57054	158 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	RND3	P61587	244 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	TERB2	Q8NHR7	220 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	MLX	Q9UH92	298 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB3D	O95716	219 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	CD74	P04233	296 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	TAS2R19	P59542	299 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.15	□□□□□ -0.3
RNPS1-222	ENST00000567147		K7EIM0	57 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	JTB	O76095	146 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	PPP5C	P53041	499 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	TMBIM6	P55061	237 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.14	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SP6	Q3SY56	376 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147		Q56UQ5	140 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A0B4J293	547 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ADM	P35318	185 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	IL18	Q14116	193 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147		I3L2K1	104 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFA4	O00483	81 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ATG12	O94817	140 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CTSG	P08311	255 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147		P0C879	139 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	AKR1C2	P52895	323 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RNPS1-222	ENST00000567147	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31

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