RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	PTTG1	O95997	202 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IFNA21	P01568	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IL5	P05113	134 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IAPP	P10997	89 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DEFA4	P12838	97 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CTRB1	P17538	263 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MFAP2	P55001	183 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	RGS21	Q2M5E4	152 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF429	Q86V71	674 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	RNF152	Q8N8N0	203 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MISP3	Q96FF7	219 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR10C1	Q96KK4	312 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM68	Q96MH6	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	RBKS	Q9H477	322 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ALG5	Q9Y673	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1B0GU03	582 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	C5orf51	A6NDU8	294 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744		H3BUA1	57 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744		M0QZ24	198 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	GOSR2	O14653	212 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SIX6	O95475	246 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DHFR	P00374	187 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CRYGC	P07315	174 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SPCS3	P61009	180 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TNFRSF9	Q07011	255 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR2C3	Q8N628	320 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	P2RX4	Q99571	388 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZFP57	Q9NU63	452 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087WW49	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SSNA1	O43805	119 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PRAF2	O60831	178 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PITX3	O75364	302 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV12-3	P01733	135 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-48	P01763	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PF4	P02776	101 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ATP5G2	Q06055	141 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	TATDN3	Q17R31	274 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C15orf32	Q32M92	178 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RAX2	Q96IS3	184 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	DNHD1	Q96M86	4753 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	FAM223B	A6NKX1	122 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		H3BP45	60 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		I3L521	148 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	WRB	O00258	174 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SSSCA1	O60232	199 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SLC25A6	P12236	298 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SNCA	P37840	140 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SLURP1	P55000	103 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	NECAP1	Q8NC96	275 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR11H1	Q8NG94	326 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR52E5	Q8NH55	327 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	DTD1	Q8TEA8	209 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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