RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RPA2	P15927	270 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GNRHR	P30968	328 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	EMP1	P54849	157 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DSCR10	P59022	87 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DEFB131A	P59861	70 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GNGT1	P63211	74 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CLINT1	Q14677	625 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PRSS8	Q16651	343 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GAPT	Q8N292	157 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	NDUFA4	O00483	81 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	NME4	O00746	187 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GLA	P06280	429 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DEFA4	P12838	97 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GTF2F2	P13984	249 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	TPBG	Q13641	420 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	LEMD1	Q68G75	181 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF2	Q99496	336 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686		S4R3C0	116 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC182	A6NF36	153 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RRAS	P10301	218 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB3A	P20336	220 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GPR183	P32249	361 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PAX9	P55771	341 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	UBE2K	P61086	200 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DAD1	P61803	113 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	HAMP	P81172	84 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CDK5	Q00535	292 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GPR176	Q14439	515 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RTL8B	Q17RB0	113 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB12	Q6IQ22	244 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SSX7	Q7RTT5	188 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	MMD2	Q8IY49	270 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ABHD1	Q96SE0	405 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	THYN1	Q9P016	225 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A0G2JND7	137 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686		M0R1X1	148 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	GABRP	O00591	440 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CHEK1	O14757	476 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CYB5B	O43169	146 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SC5D	O75845	299 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CDRT1	O95170	752 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	CRYGC	P07315	174 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SERPINA2	P20848	420 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZBTB25	P24278	435 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	3.98	□□□□□ -1.77	4e-18	■■■■■ 40.6
ATXN3-223	ENST00000553686	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	KLK9	Q2XQG4	91 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	LPCAT4	Q643R3	524 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686		Q6ZRP5	223 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATXN3-223	ENST00000553686	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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