RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	S100Z	Q8WXG8	99 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	BORCS5	Q969J3	196 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	COA4	Q9NYJ1	87 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	GPR132	Q9UNW8	380 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688		S4R3C0	116 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CENPX	A8MT69	81 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UPK2	O00526	184 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UPK1B	O75841	260 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LY6G6C	O95867	125 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IGKV1-5	P01602	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-23	P01764	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	AREG	P15514	252 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HLA-G	P17693	338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TAS2R31	P59538	309 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RND3	P61587	244 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PPP1R1A	Q13522	171 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NEURL2	Q9BR09	285 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CCDC32	Q9BV29	185 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	COMMD9	Q9P000	198 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR11H12	B2RN74	326 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NDUFB6	O95139	128 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UCP1	P25874	307 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TMEM187	Q14656	261 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SLC35G3	Q8N808	338 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SEC22A	Q96IW7	307 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	RETN	Q9HD89	108 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	BET1L	Q9NYM9	111 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SNAPC5	O75971	98 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR2J3	O76001	311 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NDUFB8	O95169	186 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	HOXB5	P09067	269 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688		Q6ZRM9	215 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	DEFB125	Q8N687	156 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ENKUR	Q8TC29	256 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	GPR146	Q96CH1	333 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	NUDT15	Q9NV35	164 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CS-233	ENST00000552688	CACNG5	Q9UF02	275 aa		5.16	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms