RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1-46P01743 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 RASL11AQ6T310 242 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-208ENST00000550358 PRSS8Q16651 343 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-208ENST00000550358 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-208ENST00000550358 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-208ENST00000550358 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRB-208ENST00000550358 J3QLI3 93 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 SRIP30626 198 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 Q8TCH9 128 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-208ENST00000550358 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 ORMDL3Q8N138 153 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-208ENST00000550358 OR11H1Q8NG94 326 aa7.08□□□□□ -1.28
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