RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	DPF1	Q92782	380 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SPIN2A	Q99865	258 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048		K7EIM0	57 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CTDSPL	O15194	276 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	RAB3D	O95716	219 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	HRAS	P01112	189 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CLEC3B	P05452	202 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR13C7	P0DN81	318 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	3.82	□□□□□ -1.8	2e-8	■□□□□ 10.8
MDM2-234	ENST00000546048	MAS1L	P35410	378 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	PIGP	P57054	158 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	RND3	P61587	244 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CBX3	Q13185	183 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	IL18	Q14116	193 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	FHL2	Q14192	279 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR4A5	Q8NH83	315 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TERB2	Q8NHR7	220 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	MCFD2	Q8NI22	146 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM63	Q969Q1	353 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	USMG5	Q96IX5	58 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM68	Q96MH6	324 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0G2JLM5	398 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM213	A2RRL7	107 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	FABP12	A6NFH5	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	FAM223B	A6NKX1	122 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF785	A8K8V0	405 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048		H0Y980	276 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048		I3L2K1	104 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	ACTL6B	O94805	426 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TPPP	O94811	219 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SERPINE2	P07093	398 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR5AC1	P0C628	307 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	GP9	P14770	177 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	PGAM2	P15259	253 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	TAS2R19	P59542	299 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CATR1	Q13166	79 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	MEF2D	Q14814	521 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	BAK1	Q16611	211 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR2C3	Q8N628	320 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	C16orf92	Q96LL3	132 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	B9D2	Q9BPU9	175 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM2-234	ENST00000546048	HINT2	Q9BX68	163 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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