RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544805.1

RNF10-222, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 2

Gene RNF10, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-222	ENST00000544805	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF429	Q86V71	674 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TEX29	Q8N6K0	151 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	WDR31	Q8NA23	367 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805		Q8TCH9	128 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	STARD4	Q96DR4	205 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PITX2	Q99697	317 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	C7orf71	A4D174	169 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM235	A6NFC5	223 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	HBE1	P02100	147 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	AQP1	P29972	269 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FAM27E3	Q08E93	113 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FUT5	Q11128	374 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	KLRD1	Q13241	179 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SYT14P1	Q58G82	188 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF695	Q8IW36	515 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MAL2	Q969L2	176 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805		A0A1W2PPK0	400 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	XRCC3	O43542	346 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CD8A	P01732	235 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SDC2	P34741	201 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TDRG1	Q3Y452	100 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MUCL1	Q96DR8	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	LINC00477	Q96M19	166 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SOST	Q9BQB4	213 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CA10	Q9NS85	328 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	POLE	Q07864	2286 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	C15orf61	A6NNL5	157 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805		K7EP34	96 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	RER1	O15258	196 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	EFNA2	O43921	213 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	NDUFC2	O95298	119 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF682	O95780	498 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SRD5A1	P18405	259 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	BCL3	P20749	454 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	LOXL3	P58215	753 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MTPN	P58546	118 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	KRTAP10-9	P60411	292 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	UNC119	Q13432	240 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805		Q6ZN92	141 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	RNF128	Q8TEB7	428 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FBXL15	Q9H469	300 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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