RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SERTAD4Q9NUC0 356 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ABCA1O95477 2261 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-214ENST00000543184 AMTP48728 403 aa11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-214ENST00000543184 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-214ENST00000543184 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 LINC00479Q96M42 142 aa11.69□□□□□ -0.54
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PRAME-214ENST00000543184 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CENPWQ5EE01 88 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TMEM140Q9NV12 185 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SELENOTP62341 195 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-214ENST00000543184 Q8N976 141 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DUSP13Q9UII6 198 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TCF19Q9Y242 345 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 V9GYV3 84 aa11.68□□□□□ -0.54
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PRAME-214ENST00000543184 RELBQ01201 579 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 RPEL1Q2QD12 228 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ERASQ7Z444 233 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 STPG4Q8N801 248 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 LRRC29Q8WV35 223 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 NRN1Q9NPD7 142 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TUBG2Q9NRH3 451 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DKK4Q9UBT3 224 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 C15orf65H3BRN8 121 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CEACAM4O75871 244 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 IGHV3-48P01763 117 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SPATA45Q537H7 98 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 FAM168AQ92567 244 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 RAB1CQ92928 201 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 HES4Q9HCC6 221 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 POLEQ07864 2286 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SIAH2O43255 324 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CA2P00918 260 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 GPX1P07203 203 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SRIP30626 198 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DYSFO75923 2080 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZNF253O75346 499 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 RAB7AP51149 207 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ZNF83P51522 516 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 PAFAH1B2P68402 229 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SGK494Q96LW2 274 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SPINT2O43291 252 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 MORN2Q502X0 79 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DSCAMO60469 2012 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 A0A1W2PS18 150 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 HELTA6NFD8 242 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 OR7C2O60412 319 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 PRDX2P32119 198 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 GNG4P50150 75 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 PLCE1Q9P212 2302 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 CHRNB4P30926 498 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ERVK-16P61578 105 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 RANP62826 216 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 MORN5Q5VZ52 161 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 Q8NA96 180 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 S1PR3Q99500 378 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-214ENST00000543184 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 CD24P25063 80 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 GNG10P50151 68 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 VWA1Q6PCB0 445 aa11.64□□□□□ -0.55
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