RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0G2JRQ6 117 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C9orf170A2RU37 121 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HMX3A6NHT5 357 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 DBX1A6NMT0 343 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYGCP07315 174 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 MYOD1P15172 320 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CTRB1P17538 263 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB9AP51151 201 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 DHRS2Q13268 280 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 KLK9Q2XQG4 91 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 NMSQ5H8A3 153 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM65Q6PI78 240 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 LYG2Q86SG7 212 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC35G3Q8N808 338 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR11H1Q8NG94 326 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ENKURQ8TC29 256 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR146Q96CH1 333 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CITED4Q96RK1 184 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 KLK15Q9H2R5 256 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 COA4Q9NYJ1 87 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A6P12236 298 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMB6P28072 239 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PRCDQ00LT1 54 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C4orf46Q504U0 113 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZRM9 215 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5T1Q8NG75 326 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52E5Q8NH55 327 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 COQ8AQ8NI60 647 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR13Q9NZ81 148 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1B0GU03 582 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ST8SIA3O43173 380 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SAP30O75446 220 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 JTBO76095 146 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PTTG1O95997 202 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 DHFRP00374 187 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IL5P05113 134 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 APELAP0DMC3 54 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 GP9P14770 177 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 AREGP15514 252 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SPNP16150 400 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 INSL3P51460 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SPCS3P61009 180 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 RUNX1Q01196 453 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 WT1-ASQ06250 92 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SMCO1Q147U7 214 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PLET1Q6UQ28 207 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 MITD1Q8WV92 249 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 USMG5Q96IX5 58 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5B12Q96R08 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CACNG5Q9UF02 275 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TNCP24821 2201 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0G2JLM5 398 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM223BA6NKX1 122 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 I3L521 148 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CYB5BO43169 146 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PITX3O75364 302 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNA17P01571 189 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TRGV3P03979 118 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8U8P0C7N1 319 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR13C7P0DN81 318 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TPPP2P59282 170 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms