RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPAN4O14817 238 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFAIP8O95379 198 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVK-16P61578 105 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 CTF1Q16619 201 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2C3Q8N628 320 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5B3Q8NH48 314 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 HINT2Q9BX68 163 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 PRNDQ9UKY0 176 aa8.77□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SNAPC5O75971 98 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 P0C879 139 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1P1Q8NH06 330 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 KLK11Q9UBX7 282 aa8.76□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 C15orf62A8K5M9 175 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 M0QYG6 137 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1-5P01602 117 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM18P0DKX4 95 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RCVRNP35243 200 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPAN5P62079 268 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF114Q8NC26 417 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10C1Q96KK4 312 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM56Q96MV1 263 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ABHD1Q96SE0 405 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SMPXQ9UHP9 88 aa8.75□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0B4J293 547 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 CYB5BO43169 146 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RORCP51449 518 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RND3P61587 244 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 PRCDQ00LT1 54 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR52I2Q8NH67 350 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 IL17DQ8TAD2 202 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF2Q99496 336 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TSC22D3Q99576 134 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.74□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 CHEK1O14757 476 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 GABARAPO95166 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-48P01763 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 PI3P19957 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZWC4 215 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LILRB2Q8N423 598 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TP53RKQ96S44 253 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TXN2Q99757 166 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.73□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 KMT2AQ03164 3969 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 MT-CO2P00403 227 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 CD3DP04234 171 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 MFAP4P55083 255 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF124Q15973 351 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 Q56UQ5 140 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4A16Q8NH70 328 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 MISP3Q96FF7 219 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.72□□□□□ -1.01
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0G2JRQ6 117 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 SPRY2O43597 315 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 CD74P04233 296 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 PIGPP57054 158 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFRSF9Q07011 255 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 MLANAQ16655 118 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms