RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	UPK1B	O75841	260 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PRH1	P02810	166 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	INSL3	P51460	131 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	RAB25	P57735	213 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SPCS3	P61009	180 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860		Q6ZRM9	215 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	OR5B12	Q96R08	314 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860		A0A1B0GU03	582 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	OR2J3	O76001	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ASAH1	Q13510	395 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860		A0A087WW49	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	NDUFB8	O95169	186 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IFNA17	P01571	189 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	TCRB	P04435	133 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	VAMP1	P23763	118 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	CACNG5	Q9UF02	275 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	OVOL1	O14753	267 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	REG1A	P05451	166 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	OR4E1	P0C645	316 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	IGLL1	P15814	213 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58	2e-6	■■■■■ 29.6
ADD1-223	ENST00000538860	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	DCUN1D4	Q92564	292 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860		G3V4G9	280 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	PITX3	O75364	302 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	SNCA	P37840	140 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	MFAP2	P55001	183 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	DHRS2	Q13268	280 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	TXN2	Q99757	166 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ADD1-223	ENST00000538860	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	CORT	O00230	105 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	GPHB5	Q86YW7	130 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	LGALS9	O00182	355 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	BMPR1B	O00238	502 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	LY86	O95711	162 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ADD1-223	ENST00000538860	CLEC3B	P05452	202 aa		11.38	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 208.3 ms