RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 TNFRSF14Q92956 283 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 BET1LQ9NYM9 111 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 SPSB4Q96A44 273 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 LY6HO94772 140 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 CD7P09564 240 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TCF15Q12870 199 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF79Q15937 498 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GLRX5Q86SX6 157 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MLNRO43193 412 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PSCAO43653 123 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MSMBP08118 114 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PSMG4Q5JS54 123 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 NPIPB7O75200 414 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GCHFRP30047 84 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ASCL4Q6XD76 172 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TEX38Q6PEX7 206 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TCF24Q7RTU0 167 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 E9PQ18 207 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G10O15496 165 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MUC21Q5SSG8 566 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 RAB24Q969Q5 203 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 E7EQL1 145 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM42Q69YG0 159 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ISOC2Q96AB3 205 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 IFITM10A6NMD0 228 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TFF3Q07654 80 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 OR52E5Q8NH55 327 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM12Q96EX1 92 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 CLPSP04118 112 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GATA3P23771 443 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 FMC1Q96HJ9 113 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 CSRP3P50461 194 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PCM1Q15154 2024 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TCF21O43680 179 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 WISP1O95388 367 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GGACTQ9BVM4 153 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 KCNS1Q96KK3 526 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 Q9H3A6 140 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GATA4P43694 442 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf61A6NNL5 157 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 RND3P61587 244 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 DPRXA6NFQ7 191 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 EFNA2O43921 213 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 RNF125Q96EQ8 232 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GAFA1Q96PS6 74 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRB-204ENST00000538708 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms