RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535896.6

SYNE1-233, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1, human

TSL 5

Gene SYNE1, Length 1,388 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNE1-233	ENST00000535896	FCGR3B	O75015	233 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CELA3B	P08861	270 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OR5G3	P0C626	314 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CRISP2	P16562	243 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	PRDX2	P32119	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ADM	P35318	185 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	SSTR5	P35346	364 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MPV17	P39210	176 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	TDGF1P3	P51864	188 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	EDDM3B	P56851	147 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	LOXL3	P58215	753 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ZNF90	Q03938	601 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	KLRB1	Q12918	225 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	EFNB3	Q15768	340 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896		Q6ZS92	163 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	SMIM12	Q96EX1	92 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ENY2	Q9NPA8	101 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	GNG12	Q9UBI6	72 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	IL19	Q9UHD0	177 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896		M0R1X1	148 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	LINC00614	P0C842	121 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CGB3	P0DN86	165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CGB7	P0DN87	165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	SELL	P14151	372 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	NDUFB7	P17568	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	BRS3	P32247	399 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	GNG4	P50150	75 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CX3CL1	P78423	397 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	PRCD	Q00LT1	54 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MIC13	Q5XKP0	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OR5B3	Q8NH48	314 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	FAM222B	Q8WU58	562 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	LRRC29	Q8WV35	223 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	SARAF	Q96BY9	339 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896		V9GYV3	84 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	C20orf202	A1L168	122 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896		K7EM74	188 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	RRH	O14718	337 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	WNT9B	O14905	357 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	PROP1	O75360	226 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	IGHV3-13	P01766	116 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CRYAA	P02489	173 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OR4A8	P0C604	315 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CECR9	P0C854	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	RNF224	P0DH78	156 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	BPIFB3	P59826	476 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	UBE2G2	P60604	165 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	LY6D	Q14210	128 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	C3AR1	Q16581	482 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	C2orf83	Q53S99	150 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OR4A47	Q6IF82	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896		Q6ZR03	302 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	CD177	Q8N6Q3	437 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	UBALD1	Q8TB05	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896		Q8TCH9	128 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	ZNF714	Q96N38	554 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	TBX15	Q96SF7	602 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYNE1-233	ENST00000535896	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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