RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 GUSBP11Q6P575 273 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR86Q86TI4 376 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 NUP35Q8NFH5 326 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.2□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM231BA6NCW3 169 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GAGE10A6NGK3 116 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 A8MWL6 223 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM238C9JI98 176 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 M0R296 226 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTL6BO94805 426 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SRFP11831 508 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SSTR5P35346 364 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 POU2AF1Q16633 256 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MAJINQ3KP22 176 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 COQ2Q96H96 371 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GNG12Q9UBI6 72 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GXF2 115 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2T8A6NH00 312 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 EPOPA6NHQ4 379 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GGTLC3B5MD39 225 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GRPP07492 148 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 IGLC1P0CG04 106 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SMIM17P0DL12 118 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM11P17152 192 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OTX2P32243 289 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR183P32249 361 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PSG9Q00887 426 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PAX2Q02962 417 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C2orf83Q53S99 150 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PSMG4Q5JS54 123 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 Q6ZVH6 145 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C1orf159Q96HA4 380 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF714Q96N38 554 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ABI3Q9P2A4 366 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF24Q9Y225 148 aa6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MED12Q93074 2177 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A0G2JMM0 328 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1W2PPB8 328 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 HIGD1CA8MV81 97 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 H3BRM9 83 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C15orf65H3BRN8 121 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 F2RL2O00254 374 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SCGB1A1P11684 91 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZXDAP98168 799 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 CR1LQ2VPA4 569 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MUC21Q5SSG8 566 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MDP1Q86V88 176 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 NCKAP5O14513 1909 aa6.18□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 ESPL1Q14674 2120 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 C7orf71A4D174 169 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PEX7O00628 323 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 COX8AP10176 69 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 PRCDQ00LT1 54 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SRYQ05066 204 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.17□□□□□ -1.42
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 178.2 ms