RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM60A	Q9NP50	221 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF492	Q9P255	531 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CCL26	Q9Y258	94 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		2.58	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0G2JND7	137 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51F1	A6NGY5	319 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LEUTX	A8MZ59	168 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		M0R381	172 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CCL22	O00626	93 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE6D	O43924	150 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR75	O95800	540 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINA7	P05543	415 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RBP1	P09455	135 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PIRT	P0C851	137 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00869	P0C866	280 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00313	P59037	77 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB13	P59910	316 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	BAP18	Q8IXM2	172 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	AMN1	Q8IY45	258 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DEFB125	Q8N687	156 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8N7P7	452 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4X1	Q8NH49	305 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SFRP2	Q96HF1	295 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00477	Q96M19	166 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LYSMD1	Q96S90	227 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SAR1A	Q9NR31	198 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CMTM6	Q9NX76	183 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	HHLA2	Q9UM44	414 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	VCAN	P13611	3396 aa		2.57	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MAST4	O15021	2626 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NED7	52 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM24	O75264	130 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MT-CO2	P00403	227 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	TTR	P02766	147 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CISD3	P0C7P0	127 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	NTF3	P20783	257 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CCL1	P22362	96 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK2	P24941	298 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	NPY1R	P25929	384 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10J1	P30954	320 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	TAS2R41	P59536	307 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DEFA1	P59665	94 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	NCALD	P61601	193 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	BTN3A2	P78410	334 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	BSPH1	Q075Z2	132 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MMD	Q15546	238 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ8	Q15842	424 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	FGF13	Q92913	245 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CMBL	Q96DG6	245 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF5	Q99942	180 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		2.56	□□□□□ -2

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