RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D19Q8N5T2 526 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDRT4Q8N9R6 151 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR7G1Q8NGA0 311 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10J5Q8NHC4 309 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC45Q96CN5 670 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OPTNQ96CV9 577 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM56Q96MV1 263 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CATSPER2Q96P56 530 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT2B28Q9BY64 529 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ULBP3Q9BZM4 244 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGCCQ9H4X1 137 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C14orf105Q9NVL8 296 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CKLFQ9UBR5 152 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSME2Q9UL46 239 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUT9Q9Y231 359 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GTQ1 180 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACOX3O15254 700 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SULT1B1O43704 296 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD14P08571 375 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF6P10767 208 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXCL3P19876 107 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALP22466 123 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE2KP61086 200 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf183Q5T699 404 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC6Q86X45 466 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T4Q8NH00 348 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C4orf3Q8WVX3 66 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A4Q9H015 551 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METTL9Q9H1A3 318 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIXL1Q9H2W2 232 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXorf21Q9HAI6 301 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARVAQ9NVD7 372 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPDR1Q9UM22 224 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PPV4 95 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FABP5P3A8MUU1 101 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF879B4DU55 563 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGCEO43556 437 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAP1O75689 374 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNAP29O95721 258 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV1-5P01602 117 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIMS3P0CW19 117 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIMS4P0CW20 117 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEKP35659 375 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PEX19P40855 299 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT4P47944 62 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T27Q8NH04 317 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10D3Q8NH80 312 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASSF5Q8WWW0 418 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00052Q96N35 136 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL19Q99731 98 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL36BQ9NZH7 164 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COMMD9Q9P000 198 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM94Q12767 1356 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIK3R4Q99570 1358 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F5H5K5 113 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FXYD1O00168 92 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGT2B11O75310 529 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD2P06729 351 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM228BP0C875 321 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FXYD4P59646 89 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS24P62847 133 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4E2Q8NGC2 313 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPCDCQ96CD2 204 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED10Q9BTT4 135 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM208Q9BTX3 173 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MROQ9BYG7 248 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WFDC10AQ9H1F0 79 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR84Q9NQS5 396 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANAPC10Q9UM13 185 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HS3ST2Q9Y278 367 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEBP20929 6669 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JMJD1CQ15652 2540 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FANCMQ8IYD8 2048 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIPP30301 263 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VSNL1P62760 191 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHEBQ15382 184 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C4orf26Q17RF5 130 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSX6Q7RTT6 188 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRLF3Q8IUI8 442 aa-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRAC1Q9NRG0 131 aa-1.33□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms