RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 KHDC3LQ587J8 217 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 Q6ZQY7 126 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPR32P1Q8NGA4 272 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR2Y1Q8NGV0 311 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 MCFD2Q8NI22 146 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 RASSF5Q8WWW0 418 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPR84Q9NQS5 396 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PARVAQ9NVD7 372 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 AK3Q9UIJ7 227 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 HS3ST2Q9Y278 367 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SNX24Q9Y343 169 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 C5orf49A4QMS7 147 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 METTL15A6NJ78 407 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF727A8MUV8 499 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 NEMFO60524 1076 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SNX4O95219 450 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ASS1P00966 412 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 CRYGCP07315 174 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 CRYGAP11844 174 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANXA8P13928 327 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 GALP22466 123 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPRR2DP22532 72 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 RHEBQ15382 184 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR10J3Q5JRS4 329 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR10J5Q8NHC4 309 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TEX47Q8TBZ9 253 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC22A4Q9H015 551 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PSTPIP2Q9H939 334 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 COQ4Q9Y3A0 265 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYO3BQ8WXR4 1341 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A1W2PPV4 95 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ATP5G1P05496 136 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TUBG1P23258 451 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 HPCAP84074 193 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 XKRXQ6PP77 449 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 VMO1Q7Z5L0 202 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 Q86TA4 180 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR2T4Q8NH00 348 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 KIFC1Q9BW19 673 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 HRASLSQ9HDD0 168 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 STMN3Q9NZ72 180 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 IL36BQ9NZH7 164 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TET1Q8NFU7 2136 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A1B0GTQ1 180 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 GP1BAP07359 652 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PSMD7P51665 324 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 VAMP3Q15836 100 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 C5orf46Q6UWT4 87 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 AHSA2Q719I0 299 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPCDCQ96CD2 204 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 MED10Q9BTT4 135 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 BCL9O00512 1426 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TNS3Q68CZ2 1445 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 H3BRM9 83 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 AHSA1O95433 338 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 RAB8AP61006 207 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 BEX3Q00994 111 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 DEFB113Q30KQ7 82 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR52E4Q8NGH9 312 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 PFN4Q8NHR9 129 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 BBS2Q9BXC9 721 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 HES4Q9HCC6 221 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMEM138Q9NPI0 162 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 TAS2R7Q9NYW3 318 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-561P-201ENST00000516222 KIAA0232Q92628 1395 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 CREBBPQ92793 2442 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 DAPL1A0PJW8 107 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRM2P04554 102 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM228BP0C875 321 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 LIMS3P0CW19 117 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 LIMS4P0CW20 117 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 DLX6P56179 175 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPINK13Q1W4C9 94 aa-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms