RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IFITM3	Q01628	133 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2C1	O95371	312 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ECI1	P42126	302 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	AKR1C2	P52895	323 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	AARD	Q4LEZ3	155 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PRR25	Q96S07	402 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CSN3	P07498	182 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MLANA	Q16655	118 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CACNG5	Q9UF02	275 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487		I3L2K1	104 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	NDUFB6	O95139	128 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	DEFA4	P12838	97 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ADM	P35318	185 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	AP3S2	P59780	193 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SAP30	O75446	220 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CLEC3B	P05452	202 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	GPR183	P32249	361 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SFT2D2	O95562	160 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SPN	P16150	400 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SORL1	Q92673	2214 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PITX3	O75364	302 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ZP3	P21754	424 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	ARL3	P36405	182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	OR1P1	Q8NH06	330 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MRAP	Q8TCY5	172 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A0B4J2A0	478 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	LYRM1	O43325	122 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	ADAP1	O75689	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	MT-CO2	P00403	227 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CIZ1-222	ENST00000491487	IFNA17	P01571	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms