RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 EFNA4P52798 201 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ZNF525Q8N782 197 aa14.23□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 RNF222A6NCQ9 220 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 RNF224P0DH78 156 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PEMTQ9UBM1 199 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 C5orf52A6NGY3 159 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 LEPROTL1O95214 131 aa14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
NISCH-213ENST00000489895 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.22□□□□□ -0.13
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NISCH-213ENST00000489895 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.21□□□□□ -0.13
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NISCH-213ENST00000489895 NUDT3O95989 172 aa14.21□□□□□ -0.13
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NISCH-213ENST00000489895 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
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NISCH-213ENST00000489895 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.2□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 HLA-DRB1P01911 266 aa14.2□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 IGKV3-15P01624 115 aa14.2□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-23P01764 117 aa14.2□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 PPP1R17O96001 155 aa14.2□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.2□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-12P01611 117 aa14.19□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WV48 116 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 A0A0A6YYD4 124 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 OOSP1A8MZH6 123 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 PRCDQ00LT1 54 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 ID3Q02535 119 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 SGK494Q96LW2 274 aa14.19□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 CEACAM4O75871 244 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 LYNX1P0DP58 116 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 SRIP30626 198 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TAS2R60P59551 318 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 A6NJY4 79 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JNJ9 132 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 ZNF98A6NK75 572 aa14.18□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 ASIPP42127 132 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 RNF126Q9BV68 326 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 METRNQ9UJH8 293 aa14.18□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 CBY3A6NI87 242 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TMEM178BH3BS89 294 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 FOLR2P14207 255 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 Q6AWC8 147 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 NMUP48645 174 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 S4R3C0 116 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GW15 77 aa14.17□□□□□ -0.14
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