RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 GPR31O00270 319 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 ERVK-16P61578 105 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TNFRSF9Q07011 255 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 Q56UQ5 140 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 LILRB2Q8N423 598 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 OR2C3Q8N628 320 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 C15orf61A6NNL5 157 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 I3L2K1 104 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SNAPC5O75971 98 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 CTSGP08311 255 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 MLANAQ16655 118 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 IL17DQ8TAD2 202 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SEC22AQ96IW7 307 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 RNF2Q99496 336 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 KLK11Q9UBX7 282 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A087WXM4 84 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A0G2JRQ6 117 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 YIF1AO95070 293 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 MT-CO2P00403 227 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 IGKV1-5P01602 117 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 PPP5CP53041 499 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TAS2R46P59540 309 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TSPAN5P62079 268 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SP6Q3SY56 376 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 LYG2Q86SG7 212 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 OR52I2Q8NH67 350 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TP53RKQ96S44 253 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SMPXQ9UHP9 88 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 CXorf65A6NEN9 183 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM25AB3EWG3 89 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM25CB3EWG5 89 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM25GB3EWG6 89 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 NDUFA4O00483 81 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 CHEK1O14757 476 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 TSPAN4O14817 238 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SPRY2O43597 315 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 LY6G6CO95867 125 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 CD3DP04234 171 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 SMIM18P0DKX4 95 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 PGAM2P15259 253 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4A16Q8NH70 328 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 MARC2Q969Z3 335 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 THYN1Q9P016 225 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 PRNDQ9UKY0 176 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A0B4J293 547 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 DEFB4AO15263 64 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 JTBO76095 146 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 APOA1P02647 267 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 RCVRNP35243 200 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 ETV6P41212 452 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 ST8SIA2Q92186 375 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM56Q96MV1 263 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 ABHD1Q96SE0 405 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 PRR13Q9NZ81 148 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A1B0GU03 582 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 K7EMT4 169 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 ST8SIA3O43173 380 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 NXPH3O95157 252 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 TNFAIP8O95379 198 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 P0C879 139 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C5-210ENST00000489842 MFAP4P55083 255 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms