RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 RASSF5Q8WWW0 418 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ROPN1LQ96C74 230 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 OR52A5Q9H2C5 316 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SPACA1Q9HBV2 294 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CKLFQ9UBR5 152 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TNCP24821 2201 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TMEM213A2RRL7 107 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ZNF879B4DU55 563 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DISC1C4P0D8 188 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 BIRC5O15392 142 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 KCNE1P15382 129 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 UGT2B7P16662 529 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SSR2P43308 183 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MAP3K7CLP57077 242 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SPINK7P58062 85 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CCL20P78556 96 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MPV17LQ2QL34 196 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SPANXN5Q5MJ07 72 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 AADACL4Q5VUY2 407 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DHRS9Q9BPW9 319 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 HDHD2Q9H0R4 259 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DKKL1Q9UK85 242 aa-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 KCNK1O00180 336 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 HPGDSO60760 199 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 LYZL6O75951 148 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 UBL3O95164 117 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 PET100P0DJ07 73 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 RHOGP84095 191 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 PSG9Q00887 426 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R1AQ13522 171 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SPRNQ5BIV9 151 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 AADACL3Q5VUY0 350 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 GKN2Q86XP6 184 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TSKUQ8WUA8 353 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SFT2D1Q8WV19 159 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SMIM19Q96E16 107 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 C19orf60Q96EN9 201 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DERL1Q9BUN8 251 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 FKBP14Q9NWM8 211 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MED12Q93074 2177 aa-0.25□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MCM3APO60318 1980 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 EML6Q6ZMW3 1958 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MTUS2Q5JR59 1369 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 A0A0J9YY10 115 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 A0A1B0GX78 115 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TPM1P09493 284 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MAP2K4P45985 399 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 GUK1Q16774 197 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 C1orf137Q5JT78 98 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 LPCAT4Q643R3 524 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TEX261Q6UWH6 196 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SLC51BQ86UW2 128 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 GPR32P1Q8NGA4 272 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 OR4E2Q8NGC2 313 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 KCTD7Q96MP8 289 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 PRRT1Q99946 306 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TMEM147Q9BVK8 224 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ULBP3Q9BZM4 244 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 TREM1Q9NP99 234 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 RASL12Q9NYN1 266 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 U3KQ87 197 aa-0.26□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 OR2T8A6NH00 312 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ACOX3O15254 700 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CCL25O15444 150 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 BAALC-AS2P0C853 105 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 CAV1Q03135 178 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 OR51I2Q9H344 312 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MAST2Q6P0Q8 1798 aa-0.27□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms