RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 NATD1Q8N6N6 113 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF321PQ8N8H1 164 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR13C8Q8NGS7 320 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TESCQ96BS2 214 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRO3102Q9H379 93 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO44Q9H4M3 255 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMBIM4Q9HC24 238 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHRAC1Q9NRG0 131 aa-0.64□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIAA0232Q92628 1395 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 FUOMA2VDF0 154 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 B4DSR2 109 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT75O95678 551 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMP2P02689 132 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPBPP02775 128 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DQB2P05538 268 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 METTL15P1P0C7V9 234 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 STAG3L3P0CL85 134 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 HOXA6P31267 233 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 RANBP1P43487 201 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFA3P59666 94 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 VSNL1P62760 191 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 DMTNQ08495 405 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCN8Q6JVE9 175 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00575Q6W349 94 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPHB5Q86YW7 130 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf174Q8IYL3 243 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 PATE1Q8WXA2 126 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDEL1Q9GZM8 345 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 COMMD9Q9P000 198 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 EMC3Q9P0I2 261 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAIAP2Q9UQB8 552 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.65□□□□□ -2.51
CACNA2D1-211ENST00000486539 MGAMO43451 1857 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFCAB9A8MZ26 197 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R381 172 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPEO14579 308 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRASO14807 208 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYNGR1O43759 233 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBBP0CG47 229 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCAP31P51572 246 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10A3P58181 314 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFA1P59665 94 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT1XP80297 61 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf74Q32Q52 190 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MESTQ5EB52 335 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF826PQ6ZT77 177 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSX6Q7RTT6 188 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAP18Q8IXM2 172 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATOH7Q8N100 152 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R14BQ96C90 147 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NMNAT3Q96T66 252 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAT2BQ9NZL9 334 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNX24Q9Y343 169 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 BCL9O00512 1426 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGRB1O14514 1584 aa-0.66□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MBD5Q9P267 1494 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MSNP26038 577 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGTR1P30556 359 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRS3P32247 399 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP5J2P56134 94 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLA-DRB3P79483 266 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1DQ13901 141 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZS92 163 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR1M1Q8NGA1 313 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 BORCS5Q969J3 196 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC39Q96DD0 335 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HINT2Q9BX68 163 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 JPT1Q9UK76 154 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CITO14578 2027 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-0.67□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CEP192Q8TEP8 1941 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTUS2Q5JR59 1369 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf70A6NJV1 201 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 H0YIV9 168 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNK1O00180 336 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR1I1O60431 355 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HBZP02008 142 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TFPTP0C1Z6 253 aa-0.68□□□□□ -2.52
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