RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TPRA1Q86W33 373 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V0BQ99437 205 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF2Q99496 336 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.91□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 MARCH11A6NNE9 402 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf62A8K5M9 175 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R2N4 97 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CTSGP08311 255 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 GNRHRP30968 328 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TFPI2P48307 235 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPA13P48723 471 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 GABARAPL2P60520 117 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 HERV-K104P61576 105 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ERVK-16P61578 105 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 Q56UQ5 140 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N1X5 172 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CSTL1Q9H114 145 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SMPXQ9UHP9 88 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 APLNQ9ULZ1 77 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 NSG2Q9Y328 171 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ETV7Q9Y603 341 aa6.9□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0A6YYH2 397 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 A6NJ64 397 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MPTX1A8MV57 137 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLL5B9A064 214 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CHEK1O14757 476 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CDK2AP2O75956 126 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 KRASP01116 189 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RLN1P04808 185 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 F2RP25116 425 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MXD1Q05195 221 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SPARTQ8N0X7 666 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RARRES2Q99969 163 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 VCX3BQ9H321 246 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SSR3Q9UNL2 185 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DBX1A6NMT0 343 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SNAPC5O75971 98 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 YIF1AO95070 293 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA4P05014 189 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 G6PCP35575 357 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 LPAR6P43657 344 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CBX5P45973 191 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SCAND1P57086 179 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IDNKQ5T6J7 187 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CADM3Q8N126 398 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1P1Q8NH06 330 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11H2Q8NH07 326 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MFFQ9GZY8 342 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 EHFQ9NZC4 300 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 I3L2K1 104 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB4AO15263 64 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RFX2P48378 723 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR1BQ92637 280 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 BORCS5Q969J3 196 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MOB3AQ96BX8 217 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MISP3Q96FF7 219 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10C1Q96KK4 312 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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