RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DEDD2Q8WXF8 326 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 BAK1Q16611 211 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 TATDN3Q17R31 274 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 OR2C3Q8N628 320 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 ZNF502Q8TBZ5 544 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 GALNT14Q96FL9 552 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 CXorf58Q96LI9 332 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 PRR25Q96S07 402 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 THYN1Q9P016 225 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 GGCTO75223 188 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZRM9 215 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 VN1R17PQ8TDU5 208 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 CYB5BO43169 146 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 ST8SIA3O43173 380 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 OR2C1O95371 312 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 CLEC3BP05452 202 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 CSN3P07498 182 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 AKR1C4P17516 323 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 ARL3P36405 182 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 TMEM187Q14656 261 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 HAPLN4Q86UW8 402 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SORL1Q92673 2214 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 IGLV1-51P01701 117 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SPNP16150 400 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 SPINK9Q5DT21 86 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 FAM219AQ8IW50 185 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 OR1P1Q8NH06 330 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 PRR13Q9NZ81 148 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-211ENST00000480301 AARDQ4LEZ3 155 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 GPHB5Q86YW7 130 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 ZNF114Q8NC26 417 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 GPR146Q96CH1 333 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 INS-IGF2F8WCM5 200 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 K7EIM0 57 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 IFNA17P01571 189 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 TRIQKQ629K1 86 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 IL22RA2Q969J5 263 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 PEMTQ9UBM1 199 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 A6NHS1 94 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 LY86O95711 162 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 GPR183P32249 361 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 SLC35G3Q8N808 338 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 F8W735 103 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 LGALS9O00182 355 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 INPP1P49441 399 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 TMED4Q7Z7H5 227 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 OR52E5Q8NH55 327 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 I3L2K1 104 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 TGOLN2O43493 480 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 ANXA3P12429 323 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 GP9P14770 177 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 CCR6P51684 374 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 FAM106AQ4KMX7 169 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0BQ99437 205 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 CACNG5Q9UF02 275 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 A0A0B4J2A0 478 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 OR2T8A6NH00 312 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 IL7P13232 177 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 EDN2P20800 178 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 SPCS3P61009 180 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 PLET1Q6UQ28 207 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 MISP3Q96FF7 219 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-211ENST00000480301 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.89■□□□□ 0.13
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