RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5B3Q8NH48 314 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF24Q9Y225 148 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 TECTAO75443 2155 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 MT-CO2P00403 227 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 AMY1AP04745 511 aa11.13□□□□□ -0.63
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SH3BP1-206ENST00000469947 CT55Q8WUE5 264 aa11.13□□□□□ -0.63
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.12□□□□□ -0.63
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SH3BP1-206ENST00000469947 PRR20DP86480 221 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 PRR20BP86481 221 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 PRR20AP86496 221 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB31Q13636 194 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 VAMP3Q15836 100 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 MORN5Q5VZ52 161 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 PMS2CLQ68D20 193 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP1-206ENST00000469947 OR52E5Q8NH55 327 aa11.1□□□□□ -0.63
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