RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SH2D1BO14796 132 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV2-11P01706 119 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNOP22674 350 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GALR1P47211 349 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CASP6P55212 293 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 VAMP2P63027 116 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SLAQ13239 276 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C22orf46C9J442 243 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-13P01766 116 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MBP02144 154 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL14EPLP0DKL9 152 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS16P62249 146 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 EBLN2Q6P2I7 272 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf174Q8IYL3 243 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SIT1Q9Y3P8 196 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ISLRO14498 428 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE6DO43924 150 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP5P22003 454 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM78BQ5VT40 261 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD4Q96DR4 205 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RITA1Q96K30 269 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF2Q99496 336 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCL3Q9NQ33 180 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 JPT1Q9UK76 154 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SSUH2Q9Y2M2 353 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN1O95832 211 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 VWA1Q6PCB0 445 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LRP11Q86VZ4 500 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R35Q8TAP8 253 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF137PP52743 207 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4F5Q8NH21 305 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM140Q9NV12 185 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 BSNQ9UPA5 3926 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YJW9 148 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM4O75871 244 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1CBP62140 327 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MLANAQ16655 118 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR9G1Q8NH87 305 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OSTCQ9NRP0 149 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV2-23P01705 113 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SFTPCP11686 197 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBG1P23258 451 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 DLX6P56179 175 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5AN1Q8NGI8 311 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CORO2AQ92828 525 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IL36BQ9NZH7 164 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRE2 83 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OOEPA6NGQ2 149 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PRCDQ00LT1 54 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf83Q53S99 150 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 WASF3Q9UPY6 502 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PS18 150 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MGST3O14880 152 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXH1O75593 365 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf79P0CE67 100 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 S100PBPQ96BU1 408 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LOXL4Q96JB6 756 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00479Q96M42 142 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC7AQ9BXN2 247 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIAL4AQ9Y536 164 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CT45A6P0DMU7 189 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CT45A5P0DMU8 189 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CT45A7P0DMV0 189 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFBP2P18065 325 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PPOXP50336 477 aa2.92□□□□□ -1.94
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