RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MT-CO2P00403 227 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5I1Q13606 314 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 UHRF2Q96PU4 802 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51B2Q9Y5P1 312 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.29■□□□□ 0.04
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SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB4BP61018 213 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 NAGKQ9UJ70 344 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 LHBP01229 141 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM27E3Q08E93 113 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR20EP86478 221 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR20CP86479 221 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR20DP86480 221 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR20BP86481 221 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR20AP86496 221 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-202ENST00000417536 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-202ENST00000417536 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVFC1-1P60608 527 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00869P0C866 280 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MXE2 369 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QR06 171 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 IER3P46695 156 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 NEUROG1Q92886 237 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf52Q96A22 123 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CHODLQ9H9P2 273 aa15.27■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 K7ENP7 123 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP23AO75900 390 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CRISP2P16562 243 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBB3P26998 211 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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SH3BP1-202ENST00000417536 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 C9JCJ5 164 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FCN1O00602 326 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1-16P04430 117 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGB1BP1O14713 200 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00310P59036 64 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MMD2Q8IY49 270 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TBX15Q96SF7 602 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL13Q99616 98 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ACACBO00763 2458 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINK4O60575 86 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SERF1AO75920 110 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10J1P30954 320 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 GLRXP35754 106 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS4P56470 323 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SELENOTP62341 195 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 RPEL1Q2QD12 228 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPWQ5EE01 88 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 F2Z2F3 143 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 GNG4P50150 75 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MLANAQ16655 118 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 GFRALQ6UXV0 394 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM216BQ8N7L0 139 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 HELTA6NFD8 242 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SNURFLB1AK76 121 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 DLL1O00548 723 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7C2O60412 319 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZWC4 215 aa15.24■□□□□ 0.03
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